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Antoine Hubert, maître de conférences en physique depuis septembre 2025

Antoine Hubert
Antoine Hubert explore les frontières entre physique, biophotonique et neurosciences pour décrypter le développement du cerveau.
Physicien spécialisé en optique et neuroimagerie, il est maître de conférences à l’ENS Paris-Saclay depuis septembre 2025. Ses recherches visent à comprendre comment les réseaux de neurones s’organisent pendant le développement, en combinant des outils d’imagerie optique avancés et des modèles innovants comme les organoïdes cérébraux.

Son parcours 

Antoine Hubert a soutenu sa thèse en juillet 2021 à Sorbonne Université et à l’ESPCI, sous la direction d’Alexandra Fragola. Intitulée « Optique adaptative en source étendue pour la microscopie à feuille de lumière en neuroimagerie », ses travaux ont permis de corriger les aberrations optiques dans des échantillons complexes, avec une application directe en neuroimagerie chez la drosophile. Cette recherche, menée en collaboration avec Imagine Optic (partenaire industriel) et des équipes académiques (Neuro-PSI, IBENS), a ouvert la voie à de nouvelles méthodes pour l’imagerie du vivant.

Après sa thèse, il a rejoint le Laboratoire Jean Perrin (Sorbonne Université) en tant que postdoctorant, où il a contribué à la miniaturisation de systèmes optiques pour l’imagerie calcique à haute cadence chez le poisson-zèbre. Ses travaux ont également porté sur des méthodes optiques pour stimuler l’activité électrique à l’échelle cellulaire dans des environnements complexes.

Ses axes de recherche

Comprendre la structuration des réseaux neuronaux dans le cerveau humain

Une question centrale en neuroscience est de comprendre comment les réseaux de neurones s’organisent-ils pendant le développement, et quels mécanismes gouvernent leur plasticité ? Pour y répondre, Antoine Hubert combine trois approches complémentaires :

  • Des modèles innovants : otilisation d’organoïdes cérébraux humains, des structures dérivées de cellules souches qui reproduisent la dynamique du développement neuronal. Ces modèles offrent une alternative à l’imagerie animale, avec un potentiel de transfert direct en applications médicales.
  • Une imagerie optique avancée : développement de méthodes de microscopie pour observer, à haute cadence et haute résolution, les processus fonctionnels et la connectivité neuronale. Ses contributions incluent des techniques de correction des aberrations optiques dans des échantillons complexes et de la microscopie à feuille de lumière.
  • Une analyse corrélative : croisement des données d’activité neuronale avec des images structurales, grâce à des algorithmes d’analyse et de cartographie haute résolution, pour établir des liens entre fonction et connectivité.

Ses activités à l’ENS Paris-Saclay

Antoine Hubert s’investit dans la formation des étudiants au sein du Département d'enseignement et de recherche (DER) de physique, notamment à travers des travaux pratiques et des cours à l’interface physique-biologie. 

Sur le plan scientifique, il mène ses recherches au laboratoire Lumière, Matière et Interfaces (LuMIn) sur le thème de recherche "Biophotonique, optométrie et neuroscience".

Il maintient également des collaborations actives notamment avec le Laboratoire Jean Perrin (Sorbonne Université), l’Institut de Biologie de l’ENS (IBENS) et l’Institut de Reconstruction Neurobiologique de Bonn (IRN, Allemagne).

Il travaille également en étroite collaboration avec l’industrie, en particulier avec les divisions mu-Imagine et Karthala de la société Imagine Optic.